土木工程：

河海大學土木工程學科曆史悠久，1915年辦學初始即設置了土木工程方向，1922年設立“結構部”和“路工學部”，1924年著名土木橋梁專家茅以升先生任校長，為土木工程學科發展奠定了基礎。

土木工程為國家一級重點學科培育點，江蘇省一級重點學科及江蘇省優勢學科建設工程學科，二級學科岩土工程為國家重點學科，結構工程為江蘇省重點學科。設有土木工程博士後流動站，擁有土木工程一級博士學位授予權，岩土工程、結構工程、防災減災工程及防護工程、橋梁與隧道工程等四個二級學科擁有博士及碩士學位授予權和建築與土木工程專業碩士學位授予權，2016年自設道路與交通工程二級博士點。

岩土工程學科于1952年由中國岩土工程學科奠基人黃文熙院士創建， 1981年獲得首批博士學位授予權，1988年獲得首批國家重點學科（全國僅2個），且在以後曆次評估中都被評為國家重點學科。1998年土木工程設博士後流動站，2000年結構工程學科獲得博士授權，2003年獲土木工程一級博士學位授權，2009年土木工程為國家一級重點學科培育建設點。

本學科經過建設形成了六個特色鮮明的研究方向：土的基本特性與堤壩工程、岩土複雜滲流特性與環境岩土工程、岩石力學與高壩大庫工程、工程結構全生命周期性能與控制、大跨鋼橋運營安全與維護、爆炸災害預防與控制，凝練出了一批具有國内外重要影響和重大工程應用的高水平研究成果，學科整體上達到了國際先進、國内一流的水平。

在教育部2017年12月公布的第四輪學科排名中，河海大學土木工程學科并列第7位（比第三輪前進1位），位列A-，排名達到參評高校前5.2%。

交通運輸工程：

2001年獲批交通運輸規劃與管理二級碩士學位授予權，2009年獲批道路與鐵道工程二級碩士學位授予權，2011年獲批交通運輸工程一級學科碩士學位授予權，擁有交通運輸工程專業碩士學位授予權，依托我院土木工程一級學科共建道路與交通工程二級博士點。在2014年江蘇省碩士學位一級學科點評估中獲評優秀，是校級重點學科。

該學科重點在環境友好型路面結構與材料、區域多模式交通規劃與管控、特殊路基工程處治技術與理論、低碳安全的道路總體設計理論與技術、交通安全與環境等方面開展基礎理論與應用技術研究，相關成果成功應用于長三角、珠三角、京津冀等地航運、道路交通與地下隧道的規劃、設計、建設及運營工程，并凝練出包括國家科技進步一等獎在内的一批具有國内外重要影響的高水平研究成果，已成為全國交通領域有重要影響的學科。